为此,我们解析了Cyclin A3-Cdk2-Xylocydine的晶体结构,进而确定了Xylocydine的改造位点,以此为基础设计、合成了一系列Xylocydine衍生物,并阐述了它们对肿瘤细胞的作用机制,获得了以下创新性研究成果: 1)我们首次成功解析了Cyclin A3-Cdk2-Xylocydine三元复合物的晶体结构; 2)晶体结构信息表明,XylocydineKPT-330体内 C6位的Br原子是有效的修饰位点。通过对这一位置进行改造,我们合成了24个芳基和杂芳基取代的全新Xylocydine衍生物。利用体外Cdks激酶活性测定,获得了三个Cyclin A-Cdk2高选择性抑制剂,即3h、3i和3j;与Cyclin B-Cdk1相比,选择性至少提高了20倍。四甲基偶氮唑盐微量酶反应比色(3-(4,5-dimethylthselleck化学iazol-2-yl)-2,5-dipheny-ltetrazoniumbromide, MTT)结果显示,化合物3h-j对肿瘤细胞HeLa没有显著的细胞毒性,然而可以有效地阻滞HeLa细胞周期在G1/S期。这表明,3h-j在细胞内可能同样通过抑制Cdk2的活性,进而阻止肿瘤细胞的增殖。为了阐明Cdk2与抑制剂之间的构效关系,我们进行了分子对接分析17-AAG。结果表明,Xylocydine6-Br位合理地修饰,确实能够对由Lys33、Glu51、Phe80和Asp145形成的Cdk2催化中心区域进行填充,且显著提高了抑制剂对Cdk2的选择性。此外,对Xylocydine改造过程中,其嘌呤环的空间方位、嘌呤环C4位-NH2与Cdk2Leu83残基以及晶体结构数据中的呋喃糖环C11位-OH与Cdk2Asp145残基之间形成的氢键,对抑制剂的活性可能有着至关重要地影响,应给予充分地重视。