因此本研究分成二个部分: 第一部分采用生物信息学领域相关工具,全面分析发生EML4-ALK基因融合的NSCLC在肿瘤信号转导中各信号通路的变化状态,并与发生其他分子事件的肺癌组织进行比较,筛选差异表达基因,对其进行注释及归类,在整体水平初步探索EML4-ALK融合型NSCLC的发病机制、特异性的生物学行为及信号转导特征。 第二部分主要对第一部分的发现进行初步的功能验证。通过对表达谱芯片的点击此处数据挖掘,我们发现STAT3参与的诸多肿瘤生物学过程和信号转导通路在EML4-ALK融合型肺癌的信号转导中发挥了关键性作用,该基因在多条重要通路中处于枢纽位置。为初步验证STAT3的功能,我们通过RNAi技术在出现EML4-ALK融合及对照细胞系中沉默STAT3的表达,并通过构建STAT3表达载体,利用分子克隆技术,将其在靶细胞中过表达,尝试从正反两个方面论证SSelleckchem GSK1120212TAT3主导的信号转导过程中,该分子表达水平的高低对通路各关键节点的影响,并初步分析该基因与肿瘤细胞增殖、凋亡间的相互作用,为后续的临床研究及个体化治疗提供理论支持。课题设计与主要结果 第一部分EML4-ALK融合型肺癌生物学特性的数据挖掘与分析 第一章ALK表达水平与EML4-ALK融合发生的关系 目的 分析NSCLC组织中EML4和ALK基因表达水平与EMLEPZ-6438体内4-ALK融合型肺癌发生的相关性。 材料与方法 将本研究所流行病学研究的标本中质控合格的94例NSCLC组织标本制备表达谱芯片,采取customCDF的注释方法及RMA(Robust multiarray analysis)算法计算芯片杂交信号值。方差分析比较EML4-ALK融合组、非融合组和正常组织EML4、ALK两个基因的表达水平;Pearson相关分析比较两者间的相关性。 结果 customCDF注释方法共注释18123个人类基因。